Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RdxP26043 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RdxP26043 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RdxP26043 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RdxP26043 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RdxP26043 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RdxP26043 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RdxP26043 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RdxP26043 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RdxP26043 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RdxP26043 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RdxP26043 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RdxP26043 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RdxP26043 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RdxP26043 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RdxP26043 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RdxP26043 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RdxP26043 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RdxP26043 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RdxP26043 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms