Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou2f1P25425 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms