Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk11bP24788 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk11bP24788 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms