Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd11P23813 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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