Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mdm2P23804 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdm2P23804 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms