Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xrcc6P23475 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc6P23475 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc6P23475 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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