Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gja1P23242 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gja1P23242 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gja1P23242 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms