Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrneP20782 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrneP20782 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrneP20782 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms