Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prim1P20664 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prim1P20664 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Prim1P20664 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms