Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a2P20490 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms