Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcaP20444 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms