Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnc1P19123 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms