Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka3P18654 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka3P18654 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms