Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18530 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18530 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18530 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18530 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18530 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18530 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18530 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18530 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P18530 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18530 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18530 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18530 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18530 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18530 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18530 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18530 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms