Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18528 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18528 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18528 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18528 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18528 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18528 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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