Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb1P17919 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms