Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptbp1P17225 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms