Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmga1P17095 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmga1P17095 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms