Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms