Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkceP16054 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkceP16054 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkceP16054 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms