Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp53P15975 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp53P15975 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp53P15975 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp53P15975 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms