Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd5P13379 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd5P13379 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms