Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Calb1P12658 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calb1P12658 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calb1P12658 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calb1P12658 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Calb1P12658 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb1P12658 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms