Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ApcsP12246 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ApcsP12246 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ApcsP12246 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms