Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp1P11438 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp1P11438 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms