Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PolP11369 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PolP11369 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PolP11369 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PolP11369 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PolP11369 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PolP11369 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PolP11369 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PolP11369 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PolP11369 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PolP11369 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PolP11369 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PolP11369 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms