Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms