Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nid1P10493 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nid1P10493 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nid1P10493 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nid1P10493 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nid1P10493 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms