Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P10404 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P10404 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P10404 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P10404 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P10404 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P10404 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P10404 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P10404 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P10404 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P10404 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P10404 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P10404 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P10404 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P10404 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P10404 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P10404 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P10404 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P10404 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P10404 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms