Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb4P10284 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms