Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Myod1P10085 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Myod1P10085 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Myod1P10085 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms