Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Schip1P0DPB4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms