Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatspereP0DP43 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms