Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pla2g4bP0C871 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pla2g4bP0C871 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pla2g4bP0C871 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms