Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprqP0C5E4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprqP0C5E4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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