Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myl3P09542 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myl3P09542 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myl3P09542 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms