Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax1P09084 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms