Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NefmP08553 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NefmP08553 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NefmP08553 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NefmP08553 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NefmP08553 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NefmP08553 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NefmP08553 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NefmP08553 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefmP08553 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefmP08553 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefmP08553 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefmP08553 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefmP08553 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NefmP08553 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NefmP08553 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NefmP08553 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NefmP08553 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NefmP08553 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NefmP08553 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NefmP08553 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NefmP08553 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NefmP08553 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NefmP08553 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefmP08553 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NefmP08553 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NefmP08553 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms