Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Me1P06801 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Me1P06801 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Me1P06801 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Me1P06801 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Me1P06801 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Me1P06801 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Me1P06801 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Me1P06801 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Me1P06801 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me1P06801 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me1P06801 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me1P06801 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me1P06801 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me1P06801 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me1P06801 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me1P06801 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me1P06801 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me1P06801 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me1P06801 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms