Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P04213 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
P04213 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P04213 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P04213 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P04213 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P04213 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P04213 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P04213 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P04213 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P04213 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P04213 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P04213 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms