Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb1P04202 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb1P04202 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb1P04202 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb1P04202 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgfb1P04202 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms