Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Ab1P01921 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms