Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01853 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01853 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01853 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01853 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01853 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01853 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01853 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01853 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01853 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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