Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01790 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01790 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01790 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01790 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01790 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01790 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01790 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms