Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01787 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01787 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01787 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01787 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01787 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01787 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01787 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms