Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01748 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01748 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01748 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01748 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01748 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01748 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01748 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01748 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01748 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01748 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01748 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01748 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01748 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01748 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01748 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01748 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01748 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01748 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01748 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01748 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms