Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01746 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01746 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01746 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01746 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01746 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P01746 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P01746 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01746 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01746 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01746 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01746 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01746 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01746 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P01746 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms