Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01660 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01660 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01660 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01660 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01660 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01660 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01660 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01660 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01660 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01660 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01660 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01660 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms