Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Igk-V19-17P01633 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms