Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01629 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01629 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01629 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01629 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01629 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01629 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01629 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01629 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01629 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01629 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01629 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01629 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01629 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01629 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01629 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01629 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01629 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01629 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01629 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01629 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01629 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01629 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms